繼新澳門學社副理事長周庭希於今年2月底宣佈退社後，該社理事長鄭明軒日前亦於個人 FACEBOOK宣佈將離開新澳門學社領導層，辭職將於6月9日生效，並於宣佈當日起開始休假。鄭明軒表示，離開是因為自己在9月選舉發揮的作用有限，又提到學社不應忘記「內部公義」。
鄭明軒在辭職聲明中提到，「衷心期望我的離去能為學社團結奮起掃除最後障礙，並在今年選舉迎來更大的成就」。對於離開，他指並非一時衝動，離開背景亦跟周庭希不同，自己仍是學社社員。問及為何離開學社領導層，鄭表示，過往4年學社的工作大家有目共睹，今年9月選舉的成敗得失已基本有數，用往績推斷，認為學社成功的機會樂觀，而自己在9月發揮的作用有限，但身為領導，這場學社的「生存之戰」不能迴避，「如果國家要打仗，國王沒理由不上馬，但一旦我作出判斷這次競選活動不需要我，就會出現矛盾。」故唯一方法就是不參與選舉，亦退下領導層。至於是否與學社其他成員有理念之爭、意見分歧，鄭指自己一直覺得大家有一個想法，然後一起去做，比「鄭明軒想果樣嘢係圓形定四方」重要，「我好嘗試理解大家在想甚麼，大家覺得重要的是甚麼」，再提供一系列方案選擇，故不認為與社員存在所謂「理念之爭」。
鄭明軒辭職聲明中提到，「新澳門學社一直為公義在社會上不懈努力，也不應忘記內部公義亦同樣重要。程序公正之所以重要，因為儘管殊途或可同歸，但是箇中過程手法卻決定了整個事件的是非對錯。」當中「內部公義」一詞惹來不少揣測，鄭則有以下解釋：「人們常說民主政制沒效率，獨裁便好，定了方案就做，講咁多做咩。我們要效率好，還是裏面真的經過充份互相理解、溝通？很多時我們自己內部都會這樣說：如果以我們經常批評官員的標準去量度自己內部的行政，可能都頗嚴重。我們常這樣提醒自己要做好些。我們會說以前的人怎樣怎樣，有佢講冇你講，我們現在又是否每件事真的很嘗試去跟所有人好好溝通？還是像現在訪問，坐喺度得我講你哋個個碌大隻眼？其實不應該這樣。如果這不是一個訪問，而是我們在開會，大家就都應清楚了解，就算最後聽我講，大家都要解得明，都要服，唔係『就咁啦！算！』。」
「我不是說現在變成這樣，而是這個是人性，做做下都會希望想快點。這是我們自己一路警惕的。你想想多少希臘悲劇橋段就是一個年輕戰士打敗了大魔頭後，自己亦走上大魔頭的路。我覺得不應該這樣。」
「重提『內部公義』就是因為，我們在外面說要爭取公義，自己也要很警惕這回事」，又補充，認為學社「現時ＯＫ」。
鄭明軒指，現時未有具體打算，認為經過多年堅持，學社成功在政治生態中產生影響。「在好重要的矛盾、重大危機時，我們願意比其他人做更多。沒人表達時我們表達，人人出把口去表達時，我們用行動去表態，我相信這一定是學社的招牌。」被問到其離開會否令學社元氣大傷，鄭表示不認同，「根據我的往績，亦希望大家相信這不是會害大家的事，應該是對學社有益的事。」
鄭明軒辭職聲明全文：
【到此為止 This Is It】
明軒將要離開新澳門學社領導層。辭職將於6月9日生效，並於即時起休假，以便順利交接。與我合作多年的周庭希不久前也離開了學社，但我倆的離開背景並不一樣。
新澳門學社一直為公義在社會上不懈努力，也不應忘記內部公義亦同樣重要。程序公正之所以重要，因為儘管殊途或可同歸，但是箇中過程手法卻決定了整個事件的是非對錯。
人們為了不同理由去參加選舉：或為個人名利、政治理想、影響力、生意利益等等不一而足。我為了實現讓澳門更公義、更進步的理想，在2009及2013年以輔助角色跟學社參與立法會選舉選。但願學社同事們能把我這個理念延續下去。
在我考慮的期間大家慰問、勸勉、歉疚、鼓勵的說話，我都銘記於心。請相信我，決定放下參與十餘年的工作以及社團當中一切悲喜血汗，恩義人情；是艱難且痛苦的選擇。衷心期望我的離去能為學社團結奮起掃除最後障礙，並在今年選舉迎來更大的成就。
鄭明軒辭任新澳門學社理事長
